DNA甲基化是表观遗传学的热点研究领域，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用。获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。

卡梅德生物以高通量测序平台为基础，能够为用户提供DNA甲基化测序服务。我们拥有经验丰富的实验操作人员，能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱，配合完善的生信分析方法，可提供详细的测序数据和完整的实验报告，根据用户不同的研究需求，能够针对性地挖掘提炼结果数据。

DNA甲基化实验原理

DNA甲基化是较早发现的基因表观修饰方式之一，真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶，即在DNA甲基化转移酶（DNMTs）的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式是不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。

图1 DNA甲基化示意图

 服务内容

脊椎动物DNA的甲基化状态与生长发育调控密切相关，例如在肿瘤发生时，抑癌基因CpG岛以外的CpG序列非甲基化程度增加，CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态，导致抑癌基因表达的下降。为了确定DNA甲基化位点，我们能够为您提供三种解决方案：

项目	内容
亚硫酸氢盐电泳法	* 基因组DNA经亚硫酸氢盐处理后，未甲基化胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶（U），甲基化胞嘧啶不发生改变；设计不同的引物分别针对甲基化和非甲基化DNA序列，通过电泳检测PCR扩增产物进行甲基化位点鉴别。
亚硫酸氢盐测序法	* 基因组DNA经亚硫酸氢盐处理后，未甲基化胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶（U），甲基化胞嘧啶不发生改变；设计不同的引物分别针对甲基化和非甲基化DNA序列，通过测序检测PCR扩增产物进行甲基化位点鉴定。
高分辨率熔解曲线法 — 实时RT-PCR	* 设计一对针对亚硫酸氢盐处理后DNA双链的引物，若位于引物对中间DNA片段存在甲基化位点，由于经过亚硫酸氢盐处理后未甲基化胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶（U），导致样品中GC含量发生改变，从而导致熔解温度的变化。

 服务流程

DNA甲基化测序服务常见问题解答

1.我的样本是FFPE（福尔马林固定、石蜡包埋）组织，可以用于DNA甲基化测序吗？

答：FFPE样本由于其固定和保存方式，可能导致DNA降解和修饰变化。虽然可以用于DNA甲基化测序，但需要注意DNA的完整性和纯度。

2.你们可以对哪些类型的样本进行测序？我需要提供多少DNA？

答：我们可以对质粒、线性/聚合酶链式反应（PCR）样本、细菌基因组进行测序，还可根据需求承接定制项目。

3.哪些DNA甲基化测序方法适合我的研究？

答：选择合适的DNA甲基化测序方法取决于研究目的、样本类型、预算和实验需求。全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）具有单碱基分辨率，覆盖全基因组的优点； 适用于需要全面分析基因组甲基化模式的研究，如胚胎发育、疾病机制研究。简化亚硫酸氢盐测序（RRBS）具有成本较低，重点覆盖CpG岛区域优点，适用于预算有限但需要高分辨率分析CpG岛的研究。

4.如何解释测序结果？

答：甲基化水平：以百分比表示，反映特定位点或区域的甲基化程度。差异甲基化位点（DMRs）：通过比较不同样本组，识别甲基化水平显著差异的位点或区域。功能注释：将差异甲基化位点与基因启动子、基因体、CpG岛等区域关联，分析其生物学意义。