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Oligo Pool定制服务

Oligo Pool定制服务介绍

基于Trimer Condon芯片技术,卡梅德生物提供高通量、高覆盖度的Oligo Pool(寡核苷酸池)定制合成服务。凭借成熟的工艺体系与丰富的项目经验,我们能够精准合成序列多样、均一性优异的单链寡核苷酸库,为抗体工程改造与多肽筛选研究提供稳定可靠的上游序列解决方案。 

我们不仅提供高品质的Oligo Pool合成产物,更依托公司完整的抗体发现与工程平台,可承接从文库设计、合成、扩增、载体构建,到下游展示筛选、阳性克隆鉴定及功能验证的一站式项目服务。卡梅德生物以严谨的质量控制、快速的交付周期和专业的科研支持,助力您在抗体药物研发与多肽发现领域加速创新、取得突破。

Oligo Pool介绍

Oligo Pool又叫引物池,顾名思义其内容物是多样的单链寡核苷酸,oligo pool的制备是基于Trimer Condon技术,以芯片为载体进行短片段的高通量合成。Trimer引物是3个核苷按预定种类和顺序连接起来所形成的三联核苷(Trimer phosphoramidites),这些不同的三联核苷与不同的氨基酸的一一对应。将多种Trimer引物作为整体的合成原料,合成至序列中预定位置,即可得到符合预定序列的引物池。

Oligo Pool优势

优势一:精准的定制化合成可以满足不同客户对序列的定制需求。

优势二:覆盖度高、均一性好,这一优点正好与免疫文库形成互补,提高文库多样性及均一性。

优势三:更经济、交付快,相较于双链基因的合成,单链寡核苷酸的成本会低一些,对于项目周期不足资金相对紧张但又需要文库多样性较高的客户而言,合成oligo pool后在进行双链扩增连接载体将是不错的选择。


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图1 Oligo Pool的合成优势


Oligo Pool的局限性

1. 芯片承载量

目前我司常用的芯片承载量为92K,一般合成时默认添加QC序列,QC序列为200条,也就是一张芯片上的有效库容为91.8K左右,如若客户所需合成的文库序列超出此范围建议联系我司进行方案咨询及调整。

2. Oligo Pool序列长度

Oligo pool在合成过程中会因长度的增加难度也会加大,因此合成成本也会相应增加,其中在设计过程中还要考虑同源臂的长度,建议N/C两端各加20nt的载体同源臂,以下是引物池的总长度梯度,具体引物池的合成长度要视实验方案而定。


表1 Oligo Pool的规格


芯片型号

承载量

长度

GenTitan

HiFi-92K

92K(91944)

10-79nt

80-109nt

110-130nt

131-150nt

151-170nt


3. 序列问题

在oligo pool设计之前需要有明确的序列信息,卡梅德生物会根据客户的实验需求进行序列分析及方案定制,为后续引物池的合成,文库的构建打好地基。

Oligo Pool的应用

卡梅德生物依托Trimer Condon技术进行引物池合成更多应用于肽库定制及抗体突变文库的制备。

1. 定制肽库

卡梅德生物可以提供肽库定制服务,其中包括随机多肽文库及蛋白截短肽文库,其目的大多是想要通过后续文库筛选,获得与靶标结合的多肽序列;除此之外,蛋白截短肽文库还可以通过文库筛选的方式验证蛋白与配体的互作位点,在抗体研发中也是验证其与免疫原结合表位的一种新方法。

2. 制备抗体突变文库

抗体突变文库的应用场景是增加、缺失或替换抗体某一结构的序列来探究抗体改造的影响。有些位置会影响相互作用的性质,改变其部分序列可能会导致与抗原不结合或者结合方式结合表位等发生改变,结合下游的筛库实验就可以得到多样性更高的抗体序列,在后续的抗体研发过程中也可以提供更多的可能性。

3. 实验流程


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图2 实验流程


4.案例展示-定制肽库


图3 文库鉴定结果.png


图3 文库鉴定结果


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