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核酸适配体文库筛选

2025-11-17
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一.核酸适配体


核酸适配体(Aptamer)是一段DNA序列,RNA序列,XNA(核酸类似物)或肽,常见的文库类型是DNA适配体文库以及RNA适配体文库,文库筛选往往是采用SELEX技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment),从核酸文库中经过多次操作,祛除与靶标分子不结合或弱结合的的核酸序列,不断PCR扩增富集序列,最后得到的片段可对靶标(核酸,毒素,小分子、蛋白质,离子、细胞、菌等)进行特异性识别和结合。


二.SELEX适配体文库筛选原理


体外合成随机核酸适配体文库(DNA或RNA)后,与靶标进行亲和筛选。孵育后,洗脱去除未结合组分,分离靶标-适配体复合物。以结合核酸为模板进行PCR扩增,产物作为下一轮筛选的输入文库。通过多轮筛选-扩增循环,低亲和力/非结合序列被逐步淘汰,高亲和力适配体从庞大初始文库中富集出来。随着筛选轮次增加,文库中高亲和力序列的丰度显著提升。  


      

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图1 SELEX方法的典型程序


三.核酸适配体文库筛选的抗原类型


能够用于进行核酸适配体筛选的抗原主要包括多肽、蛋白、病毒、细菌、细胞、组织,以及小分子物质。多肽和蛋白质具有复杂的结构和功能,核酸适配体能够高亲和力和高特异性地结合蛋白质;病毒和细菌作为常见的病原体,具有复杂的结构和抗原表位;核酸适配体能够与之结合,用于进行病毒和细菌的检测与诊断;细胞和组织的组成较为复杂,且存在相互作用,通过Cell-SELEX技术可以直接筛选与特定细胞或组织结合的核酸适配体,用于细胞的识别与疾病诊断等;小分子物质如药物和代谢物等,通常分子量较低且结构较为简单;因此设计与小分子结合的核酸适配体需要更高的精确度和特异性。

卡梅德生物致力于为客户提供亲和力高且有较强特异性的核酸适配体筛选技术服务,为客户后续的适配体功能验证、体内功能验证及靶向特定分子药物的开发等下游研发工作提供有力支持,包括亲和力验证、竞争ELISA验证、体外靶向细胞功能性验证、适配体的体内靶向抑制功能验证和信号通路阻断功能验证等。卡梅德生物在核酸适配体筛选(SELEX技术)方面拥有多年的项目经验和心得,经过多年的发展,卡梅德生物建立了完善的核酸适配体筛选体系,能够为客户提供高质量的针对蛋白、多肽、氨基酸、小分子化合物等靶点的核酸适配体筛选服务,包括RNA适配体文库合成服务和DNA适配体文库合成服务。卡梅德生物建立的核酸适配体文库容量可达10^10-10^11,足够筛选到针对各类靶点且满足客户下游实验需求的小分子核酸适配体。基于SELEX技术平台,卡梅德生物筛选的核酸适配体亲和力可达nM-pM级别。卡梅德生物还能提供包括但不限于核酸适配体的亲和力验证、竞争ELISA验证、流式阻断验证等多种配套的下游验证实验,客户只需要提供筛选靶点和项目需求,卡梅德生物的科学家针对客户的项目需求提供合理的定制化的方案,解决客户的科研难题。


参考文献:

[1]Kinghorn AB,Fraser LA,Lang S,Shiu SCC,Tanner JA.Aptamer Bioinformatics.Int J Mol Sci.2017 Nov 24;18(12):2516.

[2]Ji C,Wei J,Zhang L,Hou X,Tan J,Yuan Q,Tan W.Aptamer-Protein Interactions:From Regulation to Biomolecular Detection.Chem Rev.2023 Nov 22;123(22):12471-12506.

[3]Kohlberger M,Gadermaier G.SELEX:Critical factors and optimization strategies for successful aptamer selection.Biotechnol Appl Biochem.2022 Oct;69(5):1771-1792.

 

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SELEX技术
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